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作物可以吸收有機含磷化合物,如己糖磷酸酯、蔗糖磷酸酯、卵磷脂及植素等。磷是作物體內移動性很大的營養元素,當形成新的組織時,磷可以轉移到這些組織中,因此可以重復使用。作物在生長初期吸收的磷占總吸收量的60%-70%,而后者主要取決于體內磷的運輸和再利用。一般作物對磷的敏感期處于苗期,特別是對于谷子粒較少的作物。通常,磷肥的施用越早,利用率越高,因此磷肥更適合用作種子肥料和基肥。
磷缺乏對作物的光合作用,呼吸作用和生物合成過程有影響,對代謝的影響將不可避免地反映在生長中。在缺磷的早期,葉子通常是暗綠色,許多一年生作物(例如玉米)的莖通常表現出典型的紫紅色癥狀。從植物的外觀來看,它們通常顯示出生長緩慢,植物矮小和結實狀況差。不同的植物物種具有不同的磷缺乏癥狀。作物缺磷的癥狀通常先出現在老葉子上。
磷肥過量時,葉片肥厚而密集,葉片顏色為深綠色。植株矮小,節間太短。出現明顯的生長受限癥狀。由于施用過量的磷肥,繁殖器官通常會加速成熟過程,從而導致營養體小,莖葉生長受限以及產量降低。磷肥的過量施用還表現為植株地上部分的生長與根系之間的不平衡,雖然地上部分的生長受到限制,但根系發達,根量多而粗短。此外,還會出現葉用蔬菜的纖維素含量增加、煙草的燃燒性差等品質下降的情況。過量施用磷肥也會引起鋅,錳和其他元素代謝紊亂,這通常會導致植物體內鋅缺乏。